한줄평
“윈도우 환경에서 RNA-seq 정렬을 수행해야 하는 연구자에게 실용적입니다. 다만 일반 사용자용이 아니라 생명정보학 지식과 큰 메모리·연산 자원이 필요합니다.”
이런 분께 윈도우에서 RNA-seq 데이터를 정렬하는 연구자께
좋은 점
- 리눅스 없이 윈도우에서 STAR 정렬 수행
- 빠른 RNA-seq 리드 매핑 성능
아쉬운 점
- 생명정보학 전문 지식과 상당한 시스템 자원이 필요
WinNGS STAR 소개
RNA 시퀀싱(RNA-seq) 데이터를 참조 유전체에 정렬하는 STAR 정렬기의 커뮤니티 윈도우 빌드입니다. 대량의 시퀀싱 리드를 빠르게 매핑해 주는 생명정보학용 명령줄(CLI) 도구입니다. 리눅스 위주였던 STAR를 윈도우에서 바로 돌리고 싶은 연구자가 씁니다. 유전자 발현 분석 파이프라인의 정렬 단계에 쓰입니다.
